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2019第四屆PLAGH-MIT醫(yī)療大數(shù)據(jù)Datathon活動(dòng)圓滿舉行

 2019-11-20 13:52  來源:互聯(lián)網(wǎng)  我來投稿 撤稿糾錯(cuò)

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"2019中國醫(yī)院協(xié)會(huì)醫(yī)學(xué)工程專業(yè)委員會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)暨第四屆PLAGH-MIT醫(yī)療大數(shù)據(jù)學(xué)術(shù)交流及Datathon活動(dòng)”,2019年11月14日至17日在北京石景山景園假日酒店舉行。該活動(dòng)由中國人民*總醫(yī)院聯(lián)合麻省理工學(xué)院、哈佛醫(yī)學(xué)院、清華大學(xué)數(shù)據(jù)科學(xué)研究院、《中國醫(yī)療設(shè)備》 雜志社、中國醫(yī)院協(xié)會(huì)醫(yī)學(xué)工程專業(yè)委員會(huì)、北京生理科學(xué)院危重癥醫(yī)學(xué)專業(yè)委員會(huì)共同舉辦,Datahon環(huán)節(jié)引入了和鯨科技和AWS作為技術(shù)支持方,分別提供數(shù)據(jù)科學(xué)協(xié)同平臺(tái)與云資源支持。

本次Datathon活動(dòng)分為賽前培訓(xùn)、課題路演、團(tuán)隊(duì)招募、成果展示和評(píng)審頒獎(jiǎng)六個(gè)環(huán)節(jié),這個(gè)過程需要在幾天內(nèi)完成,不僅考驗(yàn)了每一位參賽隊(duì)員的專業(yè)技術(shù)能力,更考驗(yàn)了每個(gè)團(tuán)隊(duì)的協(xié)作配合。

11月15日晚,課題路演正式開始,來自全國各地的隊(duì)長紛紛登臺(tái),每個(gè)人用120秒的時(shí)間針對(duì)自己團(tuán)隊(duì)課題進(jìn)行路演展示,并在現(xiàn)場招募隊(duì)員。本屆Datathon課題是臨床方向,隊(duì)長大都為臨床醫(yī)生,大量與臨床醫(yī)學(xué)密切相關(guān)的課題被提出。由于算法工程師和數(shù)據(jù)科學(xué)家的數(shù)量稀缺,他們成為了招募現(xiàn)場的主要對(duì)象。

經(jīng)過三個(gè)半小時(shí)緊張激烈的路演與招募,24個(gè)由臨床醫(yī)師、算法工程師、醫(yī)療大數(shù)據(jù)工程師組成的跨領(lǐng)域隊(duì)伍集結(jié)完畢,隊(duì)員們針對(duì)問題作出積極討論,開啟了接下來為期兩天的跨界研究工作。為期兩天的活動(dòng)時(shí)間十分緊張,為了能夠得到有價(jià)值的研究成果,各個(gè)隊(duì)伍的成員們廢寢忘食,毫不懈怠,為了課題進(jìn)展討論至深夜。

值得一提的是,每屆Datathon活動(dòng)都會(huì)有來自MIT,哈佛醫(yī)學(xué)院的國外專家團(tuán)隊(duì)給隊(duì)伍提供指導(dǎo),專家們有著豐富的醫(yī)學(xué)及數(shù)據(jù)科研經(jīng)驗(yàn),他們把每個(gè)參賽小組的課題進(jìn)行逐個(gè)討論,探討題目的可行性、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的合理性、研究方向的創(chuàng)新性以及課題與所用數(shù)據(jù)庫的關(guān)聯(lián),并根據(jù)實(shí)際情況給出切實(shí)可行的建議。

課題初審之后,這些國內(nèi)外的專家還被分配到各個(gè)參賽小組,一對(duì)一輔導(dǎo)參賽團(tuán)隊(duì),針對(duì)每個(gè)團(tuán)隊(duì)的優(yōu)勢(shì)和短板提出解決路徑,確保課題方向優(yōu)中選優(yōu),幫助各團(tuán)隊(duì)繞開彎路,提煉靈感,進(jìn)一步促成高質(zhì)量結(jié)果。這個(gè)過程也像一次難得的開放式教育,通過引入國際化專家團(tuán)隊(duì),幫助參賽者在較短的時(shí)間內(nèi)掌握醫(yī)療數(shù)據(jù)科研選題方法和數(shù)據(jù)分析技能。

在課題研究過程中,每一位成員都要或多或少地接觸到數(shù)據(jù)分析,不同角色之間也需要基于數(shù)據(jù)進(jìn)行協(xié)作,而一個(gè)能滿足團(tuán)隊(duì)協(xié)同的數(shù)據(jù)分析工具顯然對(duì)研究起到了很大的推動(dòng)作用,通過和鯨科技的“數(shù)據(jù)科學(xué)協(xié)同平臺(tái)”K-Lab,讓復(fù)合背景的團(tuán)隊(duì)協(xié)作在Datathon當(dāng)中得以實(shí)現(xiàn),產(chǎn)出基于數(shù)據(jù)科學(xué)方法構(gòu)建的研究方案,并更深入地研究和完成最終成果。

經(jīng)過兩天的合力工作,各個(gè)團(tuán)隊(duì)最終都產(chǎn)出了自己的研究成果,并以PPT形式進(jìn)行匯報(bào),來自哈佛、MIT和301醫(yī)院的專家代表團(tuán)為各個(gè)隊(duì)伍打分和提出評(píng)審意見,評(píng)審和打分流程都基于K-Lab平臺(tái)進(jìn)行,除了提交用于展示課題成果的幻燈片之外,每個(gè)隊(duì)伍還需要基于K-Lab提交數(shù)據(jù)分析所用的代碼,以保證成果可復(fù)現(xiàn)性,12支隊(duì)伍最終脫穎而出。

頒獎(jiǎng)典禮上,*總醫(yī)院的張政波主任說:“Datathon活動(dòng)其實(shí)不止是一次競賽,更是一個(gè)學(xué)習(xí)交流的過程,大家在這次這個(gè)過程中思考、體會(huì),發(fā)現(xiàn)自己的強(qiáng)項(xiàng)和不足,找到互補(bǔ)的團(tuán)隊(duì)和伙伴,推動(dòng)學(xué)科的領(lǐng)域的科學(xué)研究,所有人在Datathon中都是贏家。”

活動(dòng)最終評(píng)選出一等獎(jiǎng)1項(xiàng),二等獎(jiǎng)3項(xiàng),三等獎(jiǎng)5項(xiàng),分別由來自北京理工大學(xué)、*總醫(yī)院、中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院、浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬邵逸夫醫(yī)院、首都醫(yī)科大學(xué)等單位的團(tuán)隊(duì)獲得。

一等獎(jiǎng)是北京理工大學(xué)辛怡教授帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì),他們研究的題目是根據(jù)ICU患者的生命體征和治療方式預(yù)測(cè)血清鈉的水平,因?yàn)殁c離子是細(xì)胞外液的主要陽離子,血清鈉對(duì)維持體內(nèi)電解質(zhì)平衡、酸堿平和和滲透壓皮鞥恒起到關(guān)鍵作用,他們根據(jù)患者生命體征和治療方式的血清鈉建立了機(jī)器預(yù)測(cè)模型,并根據(jù)這一模型做出了演示APP應(yīng)用。在兩天時(shí)間內(nèi),這個(gè)成果是驚人的。

作為現(xiàn)場少見的算法出身團(tuán)隊(duì),獲獎(jiǎng)團(tuán)隊(duì)的隊(duì)長辛怡教授對(duì)表示,這是團(tuán)隊(duì)第三年參與Datathon活動(dòng)了,第一年參加時(shí)是在其它團(tuán)隊(duì)中參與課題,第二年就將自己團(tuán)隊(duì)研究的課題帶到比賽中,得到很多來自MIT和哈佛的教授評(píng)委的指點(diǎn),所以今年團(tuán)隊(duì)將課題再次優(yōu)化,并在現(xiàn)場進(jìn)行臨床醫(yī)學(xué)和醫(yī)學(xué)工程隊(duì)員招募,將研究進(jìn)一步落地推進(jìn)。

“我認(rèn)為Datathon是一個(gè)非常難得的機(jī)會(huì),能夠讓學(xué)生們接觸到在學(xué)校里無法嘗試的完整項(xiàng)目,和整個(gè)團(tuán)隊(duì)一起,從提出問題到做出這個(gè)問題的解決方案,并且接觸到醫(yī)學(xué)背景很強(qiáng)的臨床醫(yī)師,讓科研的深度和廣度都得到提升。所以這次我不僅帶上了我的研究團(tuán)隊(duì),更帶上了很多我的本科學(xué)生來學(xué)習(xí)觀摩,希望每一位學(xué)生都要有一次這樣的體驗(yàn)。”辛怡教授說。

為期四天的Datathon結(jié)束了,但跨學(xué)科的創(chuàng)新協(xié)作卻剛剛開始。據(jù)悉,本次Datathon的成果,將會(huì)在進(jìn)一步細(xì)化整理后,以論文形式公開發(fā)表,后續(xù)的合作也將持續(xù)進(jìn)行。

數(shù)據(jù)科學(xué)的發(fā)展,使得醫(yī)療科研在研究方法、運(yùn)作方式、傳播交流等方面發(fā)生了深刻變革,能夠熟練掌握大數(shù)據(jù)技術(shù)的醫(yī)生,其科研成果也普遍有著更高的行業(yè)影響力。中國目前針對(duì)醫(yī)療領(lǐng)域的大數(shù)據(jù)教學(xué),還處于起步階段,Datathon這種能夠促進(jìn)跨學(xué)科人士交流、并提供完備的基礎(chǔ)設(shè)施和數(shù)據(jù)素材進(jìn)行開放式科研協(xié)作的活動(dòng),顯得更加難能可貴。

隨著數(shù)據(jù)的增加,值得科研人員探索的問題也在變多、變難,Datathon的開放科研模式,以數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)與協(xié)作為橋梁,建立起了多學(xué)科之間的深入合作,為科研工作的形態(tài)打開了全新的可能。

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